世界各地的GMP指导原则均要求与药品接触的表面不应该具有反应活性，且既不添加也不吸收成分，避免因其导致药品的安全或效用不符合法规或其它制定的要求。因此进行过滤系统相容性研究就变得非常关键。相容性研究可分为兼容性实验，吸附实验，可提取物实验。过滤系统相容性研究的具体介绍如下所述： 兼容性实验：膜过滤器通常用在无菌药物生产过程中，其去除微粒和微生物的主要机制是孔径大小排除。如果产品与聚合物膜的化学性质不兼容，则浸泡在产品中膜片的孔径大小可能会发生改变，并进一步影响到膜的细菌截留能力。因此，有兼容性实验证明膜浸泡在产品中不影响孔径大小是非常重要的。这个文件证明可作为所选择的过滤器是否适用于相应工艺的初步确认。 吸附实验：导致吸附现象的机理包括了多种力的相互作用，例如药物产品本身，离子键，范德华力和疏水键等。此外，一些工艺因素，如过滤膜面积，过程流量（按接触时间计算）；产品浓度，药品溶液本身的离子强度也都会影响过滤膜对产品的吸附量。而生产过程的动态变化决定了吸附试验是在等比例缩小的动态模式下进行的。 可提取物实验：可提取物测试是过滤系统相容性研究中的一部分。在实际生产工艺中，过滤器材料上的一些组分可能迁移进入到药品中。如果药品中含有可提取物成分，则需要对其进行研究。 然而，用实际药品检测过滤器可提取物成分的方法并不适用。在大多数情况下，活性药物成分为有机溶质，而过滤器产生的可提取物成分为有机高分子材料。由于药物成分的浓度远远大于潜在的过滤器可提取物浓度，因此几乎很难开发一种合适的分析方法，能够准确可靠地检测可提取物成分。